El año 2000 marcó un punto de inflexión en la dinámica del conflicto armado y sus manifestaciones para Nariño ya que a raíz de las intensas fumigaciones a los cultivos de coca emprendidas por el Gobierno en el vecino departamento del Putumayo en el marco del Plan Colombia, originó que los cultivos de uso ilícito se desplazaran hacia Nariño, especialmente al litoral del Pacífico, trayendo consigo el aumento de la presencia de los actores armados (Guerrillas y paramilitares) y as acciones de guerra. Fue en este contexto que el 15 de enero de 2002 cuatro jóvenes hombres y mujeres economistas de la Universidad de Nariño comprometidos con el ideal de cambio social, deciden crear a Fundación Desarrollo y Paz, FUNDEPAZ como respuesta a las nocivas consecuencias del incremento del conflicto armado sobre la población civil: aumento de las violaciones a los derechos humanos, desplazamientos masivos de población, aumento de la pobreza, etc.