El trabajo de FUNDEPAZ se hace con base a:

Neutralidad
Para FUNDEPAZ la neutralidad no significa ser testigos pasivos de los acontecimientos sino que esta debe promover acciones dirigidas a contribuir al restablecimiento de la paz y, más genéricamente, a la difusión de una cultura fundada en el diálogo y la no violencia.

Voluntariado
Como cultura del servicio y la gratuidad, como alternativa a la competitividad y el economicismo, en orden a la transformación más justa y solidaria de la sociedad. El voluntario asume las responsabilidades de los órganos de gobierno, dirección y gestión.

Independencia
FUNDEPAZ es una organización aconfesional y apartidista que lleva a cabo su misión sin discriminar por razones de raza, religión o sexo u otra condición.

Dignidad humana
FUNDEPAZ afirma el derecho a la dignidad de las personas, familias y comunidades donde trabaja y colabora con ellas en la constitución de un mundo justo.

Solidaridad
FUNDEPAZ cree que la cooperación es una relación bilateral entre dos sujetos de igual dignidad, basada en la confrontación y en el diálogo; hacer cooperación significa, por tanto, trabajar conjuntamente con las comunidades para comprender los problemas, identificar las necesidades y determinar junto a éstas las soluciones y las respuestas más adecuadas

Transparencia
FUNDEPAZ actúa con transparencia en los objetivos, en las estrategias y en las modalidades de acción, así como en la gestión de los recursos (económicos y humanos) y representa una condición necesaria para que nuestro trabajo sea eficaz.

Equidad de Género
FUNDEPAZ cree que para lograr establecer en la sociedad una verdadera igualdad, se requiere tratar a cada cual según sus particulares circunstancias, es necesario tomar en cuenta las diferencias reales, el contexto social y las condiciones culturales en que las relaciones se dan.