El 2000 marca el año en cual el conflicto y las manifestaciones de violencia se incrementaron en Nariño a raíz de las intensas fumigaciones a los cultivos de coca emprendidas por el Gobierno en el Putumayo en el marco del Plan Colombia, lo cual hizo que los cultivos ilícitos se desplazaran hacia Nariño, especialmente al litoral del Pacífico, trayendo consigo el aumento de la presencia de los actores armados (Guerrillas y paramilitares) con el consecuente escalamiento del conflicto armado. Ante este panorama, el 15 de enero de 2002 cuatro jóvenes economistas de la Universidad de Nariño comprometidos con el ideal de cambio social, deciden crear a Fundación Desarrollo y Paz, FUNDEPAZ como respuesta a las nocivas consecuencias del incremento del conflicto armado sobre la población civil: aumento de las violaciones a los derechos humanos, desplazamientos masivos de población, aumento de la pobreza, etc.